Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG13O75143 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG13O75143 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG13O75143 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATG13O75143 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATG13O75143 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms