Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GMDSO60547 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms