Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms