Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCO2O43819 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCO2O43819 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCO2O43819 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms