Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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XRCC2O43543 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC2O43543 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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