Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC4O15439 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms