Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VGFO15240 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VGFO15240 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VGFO15240 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VGFO15240 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VGFO15240 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VGFO15240 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGFO15240 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VGFO15240 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VGFO15240 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VGFO15240 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGFO15240 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGFO15240 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms