Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYNJ2O15056 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms