Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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