Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KNCNA6PVL3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms