Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms