Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NBASA2RRP1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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