Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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IGHV3-16A0A0C4DH30 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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IGHV3-16A0A0C4DH30 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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