Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01558Q9Y6Z2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms