Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
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