Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms