Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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