Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms