Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms