Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms