Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPAN16Q9UKR8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms