Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms