Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms