Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms