Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms