Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms