Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms