Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms