Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms