Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL11Q9NVR0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL11Q9NVR0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL11Q9NVR0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms