Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms