Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms