Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms