Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA1Q9NP55 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms