Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms