Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms