Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms