Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC135068.6-201ENST00000625294 622 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 CYP3A43-202ENST00000312017 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 NDUFA5-211ENST00000611607 1504 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTPN20-219ENST00000508602 742 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTPN20-221ENST00000509599 945 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTPN20-222ENST00000509774 788 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTPN20-223ENST00000509900 693 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM92A-204ENST00000517718 827 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 INTS4-205ENST00000527522 956 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PROCR-201ENST00000216968 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms