Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms