Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms