Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms