Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms