Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms