Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms