Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms