Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NSMCE2Q96MF7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NSMCE2Q96MF7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NSMCE2Q96MF7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NSMCE2Q96MF7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms