Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms