Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms