Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCC1Q92922 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms