Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms